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IPK Gatersleben
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核心人物2
- 01
Thomas Altmann
分子遗传学系主任 · 上级负责人
下设自动化植物表型组，统辖 PhenoSphere
- 02
Dimitar Douchkov
Microphenomics 联系人
项目与产品时间线 3 个节点
- 2011
-
HTPheno 图像分析流程
发表于 BMC Bioinformatics 2011
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- 2014
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IAP 开源高通量表型信息系统
Integrated Analysis Platform，Plant Physiology 2014, 165:506
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- 2020
-
多模态图像自动分割方法
两步配准-分类方法，Plant Methods 2020
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以下为规模较小或项目数较少、不单独成文的物理实验平台。规模较大的已拆出独立文件，见 README 索引。
| 项 | 内容 |
|---|---|
| 机构 | Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)，萨克森-安哈尔特州 |
| 供应商 | LemnaTec 高通量系统，共 3 套 |
| 上级负责人 | Prof. Dr. Thomas Altmann，Head of Department of Molecular Genetics —— 该部门下设 Automated Plant Phenotyping 组并统辖 PhenoSphere |
| Microphenomics 联系人 | Dr. Dimitar Douchkov |
| 设施总负责人 | 仍未能核实 —— IPK 表型基础设施页只列平台（IPK PhenoSphere、Greenhouse Systems、NMR Platform、Microphenomics），未设具名的统一负责人职位 |
8.1 三套按植株尺寸分级的表型系统
| 系统 | 目标作物 | 容量 | 环境 |
|---|---|---|---|
| 小型植物系统 | 拟南芥 | 384 个运输载具，视配置 384–4608 株 | 人工气候室 |
| 中型植物系统 | 谷物 | 520 株同时测定 | 气候控制温室 |
| 大型植物系统 | 玉米等 | 396–1584 株 | 气候控制温室 |
- 小型与大型系统还支持根系构型无损记录（专门设计的斜面盆 + 红外检测）
传感器：三个串联成像仓 —— 可见光（390–750 nm）、近红外（1450–1550 nm）、荧光（激发 400–500 nm / 发射 520–750 nm）；LED 相机面板基于 PAM 脉冲调幅原理测光合参数；俯视 + 侧视双视角。
软件产出（IPK 的重要贡献）
- HTPheno 图像分析流程（BMC Bioinformatics 2011）
- IAP (Integrated Analysis Platform) 开源高通量表型信息系统（Plant Physiology 2014, 165:506）
- 多模态图像自动分割的两步配准-分类方法（Plant Methods 2020）
照片
IPK LemnaTec 系统成像舱内景：一株谷物（大麦/小麦）置于白色盆中，由蓝色托盘固定于传送带上，四周为铝型材框架与可调节的挡板；背景蓝色/粉色为成像用的标准化背景板与光源。来源：ipk-gatersleben.de
